Em substituição à Copa da Uefa, a Liga Europa tem sua quarta edição na temporada 2012-2013. Na nova competição, a primeira fase após os playoffs classificatórios já é disputada no sistema de grupos.

São 12 grupos com quatro equipes cada um, avançando os dois primeiros colocados. Cada time faz seis jogos, sendo três em casa e três fora.

Aos 24 classificados à segunda fase, se juntam os terceiros colocados dos oito grupos da primeira fase da Liga dos Campeões, que dá vaga à sua fase eliminatória apenas aos dois primeiros de cada chave.

Então, os 32 times sobreviventes disputam etapas em sistema de mata-mata até a decisão. Seguem na disputa pelo título os times que somarem o maior número de gols nos dois jogos da fase.